¿Cómo cambian tus mutaciones tu biología?

La variante india, que ha estado circulando durante algunas semanas en la India, porta varias mutaciones en su proteína S. ¿Cómo afectan sus interacciones con el receptor de células ACE2 o los anticuerpos neutralizantes? Un estudio prepublicado ofrece las primeras respuestas.

India es el segundo país más afectado por Covid-19 del mundo, por delante de Brasil y detrás de Estados Unidos, con 17,3 millones de casos confirmados. En las últimas semanas, laEpidemia se salió de control. El número de casos está aumentando exponencialmente, al igual que el número de muertes. Solo el 25 de abril de 2021, se confirmaron 350.000 nuevas infecciones. Varios países, incluidos Francia, el Reino Unido y los Estados Unidos, se han comprometido a apoyar al país. En Nueva Delhi, la capital, el confinamiento se extiende por una semana.

Este aumento sin precedentes de la epidemia está relacionado con la propagación de la variante india de SARS-CoV-2 ? Aún no se ha identificado ninguna relación de causa y efecto. Las mutaciones que puerta, y que ya se conocen, le confieren cierta ventaja evolutiva, favoreciendo su propagación. Tres de ellos, L452R, E484Q y P681R están sujetos aun pequeño estudio publicado en el servidor bioRxiv por científicos del Instituto Nacional de Virología de Pune. Gracias a cristalografía, pudieron analizar las interacciones entre proteína S de la variante india y el receptor ACE2.

Un vínculo más fuerte con ACE2 …

Las mutaciones L452R y E484Q se encuentran en el dominio de conexión al receptor (RBD) de la proteína S, la región que interactúa físicamente con ACE2. En variantes que no tienen la mutación L452R, el leucina (L) se forma con otros dos aminoácidos vecinos, un bolsillo hidrofóbico en la superficie del RBD. En la variante india, la leucina se reemplaza por un arginina (R) que no es hidrofóbico. Por tanto, la bolsa hidrófoba se rompe. Según los cálculos de los científicos, la formación del complejo indio mutante ACE requiere menosenergía (-94543,180 kcal / mol) en comparación con la cepa no mutada (-93732,305 kcal / mol).

ME’ácido glutamico en la posición 484 de la proteína S (E484) forma un enlace electrostático con un residuo del receptor ACE2. Reemplazado por un glutamina en la variante india (E484Q), este enlace ya no existe. Los científicos creen que el complejo RBD-ACE2 en el caso de la variante india es más estable, en particular debido a la desaparición de la bolsa hidrófoba.

Otra mutación, P681R, no se localiza en el RBD, sino en la región de acción de furina, un proteasa que corta una cadena de aminoácidos básicos. En la variante india, el prolina (P) se reemplaza por una arginina (R), que es precisamente uno de los aminoácidos reconocidos por la furina. La acción de este último es fundamental para separar los dos subunidades de proteína S e iniciar la Fusión virus con la membrana de la célula huésped. Por tanto, la mutación P681R podría aumentar la tasa de fusión de la membrana y la internalización del virus y, automáticamente, su transmisibilidad, según los científicos.

… y con anticuerpos debilitados

Los científicos indios también han observado cambios en la interacción entre el mutante indio y un anticuerpo. monoclonal neutralizador (REGN10933). Como se señaló para otras variantes, la mutación E484Q previene la formación de un enlace de hidrógeno entre la proteína S y la cadena pesada del anticuerpo. La mutación L452R también priva al anticuerpo de un punto de unión al virus, esta vez una interacción hidrofóbica. Combinadas, estas dos mutaciones disminuirían la eficacia de los anticuerpos neutralizantes.

Actualmente, la variante india B.1617 no se considera una variante de interés (VOC), como las variantes inglesa, brasileña o sudafricana, sino una variante de interés (VOI). Una variante de interés presenta mutaciones que modifican su unión al receptor, reducen la acción de los anticuerpos neutralizantes y pueden complicar el diagnóstico. Si los científicos prueban que realmente es más contagioso y más lettal, entonces probablemente se considerará una variante de la preocupación.

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