Deepmind AI revela la estructura de casi todas las proteínas conocidas por la ciencia

—Christoph Burgstedt / Shutterstock.com

Apenas un año después de haber determinado la estructura de casi todas las proteínas que componen el cuerpo humano, la inteligencia artificial AlphaFold fue capaz de predecir la estructura de más de 200 millones de estas macromoléculas.

un gran reto

Llevar a cabo numerosos procesos biológicos esenciales para la vida, Las proteínas son los caballos de batalla de las células vivas.. Estos están formados por cadenas de aminoácidos que se pliegan en formas tridimensionales complejas, determinando su función. Con cálculos tan complejos que requieren una enorme potencia de procesamiento y horas de trabajo humano, el “ problema de plegamiento de proteínas representó durante muchas décadas un gran desafío científico.

Todo acelerado gracias ainteligencia artificial AlphaFold. Inicialmente entrenado en 100.000 estructuras de proteínas conocidas, este algoritmo desarrolló la capacidad de predecir la estructura única de muchos millones de otras proteínas en segundos o minutos en lugar de meses o años.

La primera base de datos AlphaFold se hizo pública en julio de 2021. Originalmente compuesta por más de 350 000 estructuras de proteínas (incluidas aproximadamente 98,5% proteína humana así como los que se encuentran en Drosophila, ratones, levaduras y E. coli), se expandió rápidamente, incorporando aproximadamente un millón de estructuras proteicas de 10.000 especies de animales, plantas, bacterias, hongos y otros organismos. El año pasado, más de 500.000 científicos de todo el mundo lo consultaron para acelerar sus investigaciones.

estructura proteica
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AlphaFold predice 214 millones de estructuras de proteínas

Su última actualización masiva lleva ese total a 214 millones de estructuras proteicas de un millón de especies, o casi todas las proteínas actualmente conocidas por la ciencia. De acuerdo con Mente profundatener esta base de datos constituye un gran activo para la investigación de enfermedades, vacunas, resistencia a los antibióticos e incluso contaminación plástica.

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» AlphaFold ya ha dado lugar a importantes descubrimientos, incluido el desciframiento del complejo de poros nucleares humanos, que regula el transporte de macromoléculas entre el núcleo y el citoplasma de la célula eucariota y está compuesto por más de 1.000 subunidades de proteínas. dice Eric Topol del Scripps Research Translational Institute. » Con esta adición masiva de estructuras de proteínas, podemos esperar que se resuelvan nuevos misterios biológicos todos los días.. »

La base de datos completa de la estructura de proteínas, más de 25 terabytes, se puede descargar de los conjuntos de datos públicos de Google Cloud.

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